Gli esperti virali non sono ancora sicuri di dove e come abbia avuto origine la variante Omicron, ma una cosa è chiara: ha superato le precedenti varianti SARS-CoV-2 e ha causato il caos. Alla fine di gennaio 2022, la variante Omicron era responsabile del 96,4% dei casi globali di COVID .
Mentre alcuni scienziati stanno concentrando i loro sforzi sullo sviluppo di terapie e vaccini per impedire che le varianti di COVID emergano per sempre, altri cercano indizi sulle origini delle varianti in un luogo improbabile: le fogne.
Tra il 40 e l'80 percento delle persone infette da COVID-19 perdono tracce di RNA SARS-CoV-2 ogni volta che respirano. Ciò rende la sorveglianza delle acque reflue uno strumento essenziale per monitorare la diffusione del virus tra le comunità. I Centers for Disease Control and Prevention (CDC) hanno recentemente annunciato l'intenzione di espandere il loro attuale programma di monitoraggio (che si estende su 400 siti) nel tentativo di tenere d'occhio le tendenze delle infezioni negli Stati Uniti
Ora un team di virologi che studia le varianti nei campioni di acque reflue di New York City ha segnalato strane sequenze non collegate a nessuno dei ceppi circolanti noti.
La ricerca è stata riportata sulla rivista Nature Communications .
"Le mutazioni che stavamo osservando nel nostro campione non erano tipiche tra nessuna delle sequenze conosciute che circolavano in quel momento", ha detto John Dennehy del Queen College.
Dennehy ha detto che queste varianti non identificate condividevano una mutazione comune nella posizione di Q498. È interessante notare che il team ha cercato nei database di sequenze note di SARS-CoV-2 da infezioni umane ma non ha ottenuto risultati: le varianti "criptiche" di New York City non corrispondevano a nessuna di quelle dei campioni clinici.
Per ora la fonte delle misteriose sequenze deve ancora essere trovata, ma gli autori offrono una serie di ipotesi sulle loro origini. Ad esempio, potrebbero essere diffusi attraverso un serbatoio di animali non umani: gli otto milioni di roditori residenti in città , forse? Ancora più preoccupante, questo potrebbe segnalare l'emergere di una nuova variante in grado di infettare gli esseri umani che deve ancora essere scoperta.
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